أبحاث جينوم السرطان البشري
مقدمة:
يركز الباحثون في مركز أبحاث مورثات السرطان البشري على مواصلة البحوث والدراسات في مختلف الاختلالات في المورثات والتغيرات الجزيئية التي تؤدي إلى ظهور الانواع الشاعة من السرطان في المملكة العربية السعودية. وقد واصل البرنامج حتى عام 2014 على أن يكون جزءاً هاماً في جمعية الجينوم و السرطان العالمية للتحليل سرطان الغدة الدرقية الحليمي. وقد اكتشف الباحثون طفرات BRAFبمستوى منخفض في سرطان القولون و المستقيم في المنطقة.
الأنشطة العامة
و يعد تعريف و تصنيف مختلف الاختلالات في المورثات والتغيرات الجزيئية التي تؤدي إلى ظهور الانواع الشاعة من السرطان في المملكة العربية السعودية هدفاً هاماً في البرنامج. هذا بالاضافة إلى القيام بالابحاث المتقدمة باستخدام التقنيات الحديثة كاستخدام الجيل الثالث من محللات الاصطفاف المعروف بأسم (الألومينا) . إن علماء وبحاثة المركز مستمرون في إنجاز دراساتهم وأبحاثهم الانتقالية لفهم التحدي في التغيرات الجزيئية والتغيرات في المورثات والتي يمكن أن يكون لها الدور الذي تلعبه في تكوين تلك الانواع من السرطانات ، وذلك عن طريق استخدام آخر ما توصل اليه العلم في التحري عن دور المورثات التي يمكن أن تسببها .
الشعب
- شعبة الأبحاث الجزيئية المرضية التجريبي بيولوجيا الخلايا الجذعية وهو المعني بانجاز الأبحاث والدراسات المعمقة لتطوير طرق تشخيص وعلاج مرض السرطان التي تهدف الى تحسين السيطرة عليه. وتعتبر هذا الشعبة من الشعب المميزة لتوفيرها أجهزة جدية في مجال البحوث الانتقالية. و من ابرز مهام الشعبة:
- تحليل بدرجة عالية التسلسل الإنتاجي على عينات من الحمض النووي لتحديد الطفرات و الخبن التي يمكن أن تلعب دورا محوريا في التسبب في السرطان.
- تحديد البروتينات المختلفه التي إما أن تكون عالية التعبيرأو أسفله عن طريق المناعية (IHC) في الأنسجة السرطانية المختلفة في شكل ميكروأري الأنسجة.
- إجراء دراسات مختبرية لتحديد مسارات الجزيئات الباقية المختلفة في مرض السرطان التي يمكن استهدافها باستخدام إما مثبطات جزيئية صغيرة ، والببتيدات، و المخدرات التي تتكون بشكل طبيعي واستراتيجيات تحليل خطوط الخلايا السرطانية باستخدام طريقة سيرنا الإنتقالية .
- وأخيرا،إجراء تأكيد على الدراسات المختبرية عن طريق تلقيح فئران التجارب أو الفئران العارية بخلايا سرطانية بمرض العوز المناعي المشترك الشديد ثم معالجتهم بأستخدام مثبطات محددة ومتابعة التقدم المحرز في هذه الأورام على مدى عدة أسابيع في الجسم الحي لتحديد انحسار الورم و موازنة البروتين للأسفل وفي نفس الوقت تحديد أي سميات مصاحبة للمثبطات في الحيوانات.
- شعبة المعلومات الحيوية تدعم هذة الشعبة كامل القسم بمستودعاً حيوياً مجهز لإدراة و دمج و تحليل بيانات الجيل الثاني من عملية التسلسل. ويتوفر في القسم أحدث الأدوات الطبية و البرامج و الحواسيب التي تلبي حاجة القسم إلى جانب وجود خوادم تخزين كبيرة للحفاظ على سلامة البيانات و النسخ الإحتياطية. ويساعد وجود الأنابيب و الأساليب و الخبرات في الشبعة في استخراج معلومات مفيدة عن طريق مسح عالي الوتيرة. و يتوفر في الشعبة أجهزة مختلفة للمعلومات الحيوية و المسح عالي الوتيرة مثل:
- تجمع الجينوم لجهاز دي نوفا
- رسم الخرائط المرجعية للجينوم
- تحليل البديل
- تحليل جزيئات الخلايا عن طريق الترانسكربتوم
- تحليل الأرقام المنسوخة و الهياكل المختلف للخلايا
- تطوير الأنابيب المخصصة
- تسلسل جينومي كامل
- التسلسل المستهدف
- تسلسل مختصر الحمض النووي الريبي
- مركز المستودع الحيوي الهدف الأساسي لهذا المركز هو الحفاظ للنماذج الأنسجة السرطانية المجمدة بأسلوب فني نمطي علمي محدد. بالأضافة إلى إستخلاص الحمض النووي و الحمض النووي الريبي من هذه الأنسجة المجمدة لتحليل الطفرات و دراسات التعبير التفاضلية في مشاريع مختلفة. ومن مهام الشعبة:
- معالجة المواد البيولوجية (أستخراج الاحمض النووية و الريبية من TME و كتل البارافين) للمشاريع البحثية المختلفة.
- أعداد كتل الخلايا من عينات سرطانية بشرية وخطوط الخلايا المستخدمة لالمناعية.
- إعداد ميكروأري الأنسجة التي تتسع إلى مئات العينات من الأورم على شريحة واحدة.
- معالجة الأنسجة الجديدة للأجزاء المجمدة من بارافين الفورمالين الثابت FFPE للأنسجة من كتل البارافين الأرشيفية صبغة الهيماتوكسيلين واليوزين.
- تخزين و مراقبة درجة الحرارة للمواد البيولوجية.
التدريب والتعليم
- البرامج و ورش العمل
- التدريب
- طلاب الماجستير و الدراسات العليا.
- العلماء والفنيين و الأطباء المقييمين و المتدربين.
- الطلاب الجامعيين و حديثي التخرج .
